Zánět ve stěně bronchů bývá přítomen již v časném stadiu nemoci. Zánětlivá infiltrace ve sliznici je tvořena převážně mononukleárními buňkami, v hlenu dýchacích cest převážně neutrofily. Na zánětu se mohou podílet též eozinofily. Distribuce lymfocytů je odlišná od astmatu, protože u CHOPN je hlavně infiltrováno podslizniční vazivo. Dochází k metaplazii pohárkových buněk. Chronická bronchiální obstrukce charakterizující CHOPN je vyvolána kombinací poruchy malých dýchacích cest (obstrukční bronchiolitidy) a destrukcí plicního parenchymu (emfyzém), které navzájem přispívají k poruše a mění se od jedince k jedinci. Chronický zánět je příčinou remodelace a zúžení malých dýchacích cest. Destrukce plicního parenchymu a také zánět vedou ke ztrátě spojení alveolů s malými dýchacími cestami, snižuje se elastické napětí plic. Vznik CHOPN se snaží vysvětlit dvě teorie - teorie nerovnováhy mezi proteázami a antiproteázami a teorie oxidačního stresu.

        Klíčová slova: Patogeneze - Zánět - Proteázy - Antiproteázy - Oxidační stres