Možnosti a využití inovované kvantitativní
fluorescenční PCR (IQFPCR) v analýze genetického
mozaicizmu pomocí gonozomálních sekvencí
Vodička R., Vrtěl R., 1Dušek L. , Švábová D. , Šantavý J.
Ústav lékařské genetiky a fetální medicíny LF UP a FN, Olomouc 1Centrum biostatistiky a analýz LF a PřF MU, Brno |
|
Souhrn:
Východisko. Kvantifikace fluorescenčně značených PCR produktů na kapilární elektroforéze (QF PCR) má své
limity především v citlivějších analýzách, ve kterých je potřebné zachytit minoritní buněčnou linii a rozpoznat malé
změny v závislosti na čase. V těchto případech může být chyba měření a reprodukovatelnost výsledků velmi
ovlivněna hlavně lidským faktorem a efektivitou PCR. Hlavním cílem studie bylo posoudit a optimalizovat kvantitativní
možnosti inovované QF PCR s přímou návazností na kvantifikaci Y sekvencí u gonozomálních mozaik.
Metody a výsledky. Arteficiálně vytvořené Y/X DNA mozaiky byly testovány a kvantifikovány inovovanou QF
PCR, která nahrazuje a rozšiřuje real-time PCR.
Na základě porovnání intenzity fluorescence PCR produktů po jednotlivých cyklech byly sestrojeny grafy nárůstu
fluorescence pro různá ředění. Analýzou podílu signálu vnitřní kontroly a příslušné mozaiky byla sestrojena
kalibrační křivka pro kvantifikaci Y sekvencí. Pro výpočet vzácných mozaik byl sestaven empirický vzorec.
Závěry. Rozšíření QF PCR o manuální real-time PCR eliminuje meze QF PCR a zpřesňuje kvantifikační analýzy
založené na PCR. Novelizovaný DNA diagnostický přístup – IQF PCR, který se vyznačuje vysokou citlivostí
a přesností, umožňuje významný posun v analýze gonozomálních Y/X mozaik.
Klíčová slova:
gonozomální mozaicizmus, kapilární elektroforéza, kvantifikace DNA, real-time PCR, QF PCR.
|
Objednat toto číslo jako -
FYZICKÁ OSOBA nebo
PODNIKATELSKÝ SUBJEKT
|