Analýza volné fetální DNA v maternální plazmě
s využitím STR lokusů
Vodička R., Vrtěl R., 1Procházka M., Šantavá A., 2Dušek L., Vrbická D.,Singh R., Krejčiříková E., Schneiderová E., Šantavý J.
Ústav lékařské genetiky a fetální medicíny FN, Olomouc 1Gynekologicko-porodnická klinika FN, Olomouc 2Centrum biostatistiky a analýz LF MU, Brno |
|
Souhrn:
Východisko. Problematika rozlišení genotypů matky a plodu v maternální plazmě těhotných žen je v současnosti
řešena většinou pomocí real-time systémů. V těchto případech je rozpoznání genotypů možné použitím specifických
sond, rozlišující jednotlivé genotypy. Nejčastější možnost se nabízí u gonozomálních sekvencí, kdy plod je mužského
pohlaví. Tato práce popisuje možnosti detekce a kvantifikace fetální DNA pomocí analýzy STR lokusů.
Metody a výsledky. K testování kvantifikačních možností kapilární elektroforézy (KE) byly použity arteficiální směsi
genotypů v rozsahu 0,2 % - 100 %, které imitují genotyp matky a plodu. K detekci fetální DNA v maternální plazmě
bylo použito 27 vzorků DNA těhotných žen v různém týdnu gravidity (t.g.). Genotyp plodu byl potvrzován genotypizací
biologického otce. Detekce byla prováděna v STR lokusech z 21. chromozómu z oblasti zodpovědné za
Downův syndrom (DS) metodikou inovované (I)QF PCR, která umožňuje zachytit a kvantifikovat i velmi vzácné
mozaiky. Kvantifikace STR lokusů na KE byla posouzena na arteficiálních mozaikách a rozlišitelnost jednotlivých
mozaik byla na úrovni několika procent. Fetální DNA byla detekována u 74 % testovaných vzorků.
Závěry. Využití IQF PCR ke kvantifikaci a rozlišení maternálního a fetálního genotypu pomocí STR lokusů by mohlo
mít význam v neinvazivní prenatální diagnostice jako další možný marker pro výpočet rizika DS.
Klíčová slova:
volná fetální DNA, kvantifikace STR, QF PCR.
|