Souhrn:
Cíl práce: Familiární adenomatózní polypóza (FAP) je autozomálně dominantně dědičné onemocnění charakterizované
vývojem stovek až tisíců adenomatózních polypů v kolorektální oblasti. V téměř 100 % případů
dochází k jejich karcinomatózní přestavbě. Tato transformace je způsobena zárodečnými mutacemi APC genu.
Projekt se zabýval optimalizací podmínek pro diagnostiku mutací způsobujících předčasné ukončení translace
a vznik zkráceného, nefunkčního proteinu.
Metodika: Pro stanovení byl použit Protein Truncation Test, umožňující detekci zkrácených proteinů na
základě in vitro transkripce/translace výchozí DNA sekvence sledovaného genu, amplifikované pomocí polymerázové
řetězové reakce (PCR). Proteiny jsou separovány polyakrylamidovou gelovou elektroforézou, přeblotovány
a chemiluminiscenčně vizualizovány.
Výsledky: Provedena optimalizace podmínek amplifikace cílové oblasti APC genu a in vitro transkripce/translace
s následnou detekcí zkráceného proteinu. Dále byly zvoleny kritéria výběru osob, testovaných na přítomnost
mutace v cílové oblasti. Funkčnost systému byla ověřena testováním pacientů s klinicky
diagnostikovanou FAP.
Závěry: Protein Truncation Test je účinným nástrojem pro presymptomatickou diagnostiku familiární adenomatózní
polypózy. V současnosti lze jeho použitím potvrdit či vyloučit přítomnost více než 70 % všech mutací
v APC genu, způsobujících tvorbu zkráceného proteinu.
Klíčová slova:
polyposis coli gen (APC gen) – familiární adenomatózní polypóza (FAP) –
protein truncation test (PTT)
|