Souhrn:
Cíl práce: Navržení a validace real-time PCR, vhodné pro kvantitativní průkaz C. pneumoniae a C.
trachomatis v klinických vzorcích.
Materiál a metody: Jako cílový úsek pro amplifikaci byla zvolena část genu pro 16S RNA. Pomocí
klonování produktu reakce v bakteriálním plazmidu byl připraven rekombinantní kalibrátor
a kombinovaný interní standard, který lze použít ve třech různých PCR. Pro validaci byly použity
archivované izoláty DNA z různých klinických vzorků, izoláty DNA z dalších infekčních agens
a kontrolní vzorky pro detekci DNA CT (QCMD) a CPN (Instand).
Výsledky: Byla ověřena specificita a reprodukovatelnost reakce. Analytická citlivost byla stanovena
na 5–10 kopií bakteriálního genomu/reakci. 105 izolátů DNA z různých typů klinických vzorků
(výtěry, moče, periferní krev, BAL) bylo vyšetřeno pomocí real-time PCR a konvenční PCR.
Vzorky, které poskytly nesouhlasný výsledek, byly charakterizovány pomocí třetího nezávislého
amplifikačního testu. Citlivost a specificita real-time PCR byla 89 % a 100 %. Metoda je vhodná pro
screening i diagnostiku chlamydií.
Klíčová slova:
Chlamydia pneumoniae – Chlamydia trachomatis – diagnostika – real-time PCR.
|